Seeds of Freedom conta a história das sementes, desde suas raízes nos sistemas tradicionais e diversos de cultivo em todo o mundo, até sua transformação em uma mercadoria poderosa, usada para monopolizar o sistema alimentar global.
O filme destaca até que ponto o sistema de agricultura industrial, e em particular as sementes geneticamente modificadas, tem impactado a enorme agro-biodiversidade desenvolvida por agricultores e comunidades em todo o mundo, desde o início da agricultura.
Seeds of Freedom busca desafiar o mantra de que, em larga escala, a agricultura industrial é o único meio pelo qual podemos alimentar o mundo, promovido pelo grupo pró-OGM. No acompanhamento da história da semente, percebe-se claramente como a agenda das empresas tem levado à aquisição das sementes, a fim de obter grandes benefícios e controle sobre o sistema alimentar mundial.